More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5134 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 197 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  62.05 
 
 		 196 aa  237  6.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  55.96 
 
 		 222 aa  210  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  50.27 
 
 		 204 aa  192  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 200 aa  192  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  51.38 
 
 		 204 aa  192  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  48.4 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 193 aa  137  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 193 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 156 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2355  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 201 aa  124  6e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 198 aa  124  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 194 aa  122  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 192 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  114  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 196 aa  111  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 196 aa  111  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2692  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 193 aa  108  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 212 aa  108  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 216 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2973  regulatory protein, TetR  53.76 
 
 		 102 aa  104  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1181  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000215765  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0948  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.627177  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1013  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1179  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 198 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288888  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0493  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 222 aa  99.4  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0117598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 193 aa  99  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 194 aa  98.2  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 201 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6698  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 193 aa  97.1  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 201 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0252  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 194 aa  95.5  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.867584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1774  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 207 aa  94.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2386  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 207 aa  94.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 213 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3212  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 193 aa  92.4  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2729  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  31.63 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 193 aa  92  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 204 aa  92.4  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3410  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 192 aa  91.3  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0110  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 193 aa  91.3  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3535  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4611  transcriptional regulator, TetR family  35.84 
 
 		 371 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2903  transcriptional regulator of TetR family protein  28.11 
 
 		 196 aa  89.4  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.453644  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 208 aa  89  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0319  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 194 aa  88.6  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 195 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1229  regulatory protein, TetR  29.32 
 
 		 235 aa  87.4  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 209 aa  85.9  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  28.95 
 
 		 195 aa  85.9  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0419  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 217 aa  85.5  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00785696  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  32.47 
 
 		 198 aa  85.9  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2762  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 207 aa  85.1  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.598965  normal  0.857853 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3643  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 193 aa  85.1  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256948 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1396  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 193 aa  84.7  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1157  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 193 aa  85.1  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 202 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133761 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33680  transcriptional regulator  42.34 
 
 		 200 aa  84.3  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5500  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 190 aa  84.7  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  decreased coverage  0.000153945 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3069  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0746648  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0178  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2779  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192265  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_2545  TetR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3393  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_26140  putative transcriptional regulator  31.38 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287141  normal  0.149256 
 
 
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NC_007802  Jann_2631  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0870793 
 
 
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NC_003910  CPS_1681  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008577  Shewana3_1158  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013169  Ksed_08040  transcriptional regulator  32.22 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_2694  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357406 
 
 
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NC_004347  SO_1578  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_2906  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0722139  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1228  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010084  Bmul_0904  TetR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0824382  normal  0.0227277 
 
 
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NC_007802  Jann_0097  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_0143  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_2408  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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