More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_08040 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_08040  transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1179  transcriptional regulator, TetR family  41.92 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288888  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 219 aa  130  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  95.9  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 198 aa  94  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 198 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  32.83 
 
 		 193 aa  89  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 213 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3753  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 207 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 200 aa  88.2  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 204 aa  85.9  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0145  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.437687  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2762  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.598965  normal  0.857853 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0493  transcriptional regulator, TetR family  32.83 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0117598 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3975  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133761 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1478  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.182244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2906  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0722139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  33.17 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3137  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4571  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 199 aa  72  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 217 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.054525 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3046  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  30 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556415 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1088  transcriptional regulator, TetR family protein  31.72 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1233  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0636137  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0419  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00785696  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4399  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2298  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283926 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8807  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  32.62 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5345  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.922777  normal  0.179588 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0319  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6698  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33680  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737103  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_2508  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1229  regulatory protein, TetR  27.51 
 
 		 235 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
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NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_2189  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
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NC_009485  BBta_2210  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.540344 
 
 
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NC_013093  Amir_4065  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
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NC_013131  Caci_5058  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_0839  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010172  Mext_4357  regulatory protein TetR  31.31 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010623  Bphy_4679  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.136213 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal  1 
 
 
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