More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0979 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  388  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  62.05 
 
 		 197 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  56.19 
 
 		 222 aa  211  7.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  51.08 
 
 		 204 aa  192  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 200 aa  184  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  50.55 
 
 		 204 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 207 aa  178  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  41.41 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 193 aa  135  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  41.24 
 
 		 193 aa  135  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 198 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 192 aa  132  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 193 aa  130  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2355  TetR family transcriptional regulator  41.34 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 205 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2692  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 193 aa  114  8.999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 196 aa  111  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
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NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 196 aa  111  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1179  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288888  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_2973  regulatory protein, TetR  56.38 
 
 		 102 aa  108  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.608159 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A1181  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 191 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000215765  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_005945  BAS0948  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.627177  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1013  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 209 aa  105  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 194 aa  104  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  37.11 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
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NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 185 aa  101  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 193 aa  97.8  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26140  putative transcriptional regulator  37.36 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287141  normal  0.149256 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2729  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 196 aa  96.7  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 195 aa  95.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6698  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 193 aa  95.5  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0493  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 222 aa  94.7  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0117598 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33680  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25370  transcriptional regulator  34.05 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.422708  normal  0.650807 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 195 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3535  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 191 aa  92  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6374  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 194 aa  92  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5500  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 190 aa  92  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  decreased coverage  0.000153945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5345  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 198 aa  92  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.922777  normal  0.179588 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4399  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 200 aa  91.7  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 195 aa  91.3  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2816  transcriptional regulator, TetR family protein  33.33 
 
 		 188 aa  91.3  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4611  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 371 aa  91.3  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2298  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1578  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0419  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00785696  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3433  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 211 aa  89.4  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2694  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 203 aa  89  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357406 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3753  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 207 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12083  transcriptional regulator, TetR family protein  28.11 
 
 		 187 aa  88.6  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2762  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 203 aa  88.6  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0530  hypothetical protein  31.72 
 
 		 198 aa  88.2  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4357  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0110  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 193 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3140  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.263348  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2189  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 202 aa  86.7  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2779  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4180  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0804485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 194 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2864  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 203 aa  84.7  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037684 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3212  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 193 aa  84.7  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013169  Ksed_08040  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  84.3  9e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_3410  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 192 aa  84.3  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208492  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_0097  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.054525 
 
 
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NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133761 
 
 
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NC_008786  Veis_0960  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.115896  normal  1 
 
 
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NC_003910  CPS_1681  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_8807  putative transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008044  TM1040_0178  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  1 
 
 
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