More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3581 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 185 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  49.73 
 
 		 208 aa  181  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2210  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  47.83 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2762  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 207 aa  156  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.598965  normal  0.857853 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3753  TetR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 207 aa  154  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0145  TetR family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.437687  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2508  transcriptional regulator, TetR family  48.12 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 205 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 216 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 196 aa  101  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6285  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6453  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6688  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 193 aa  97.8  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 206 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 193 aa  95.1  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 222 aa  95.1  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 219 aa  94  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 194 aa  92.8  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 200 aa  92.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 213 aa  92  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 213 aa  92  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 213 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 192 aa  89.4  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 198 aa  89.4  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 193 aa  88.2  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 193 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 193 aa  87.8  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 210 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2779  transcriptional regulator, TetR family  37.2 
 
 		 200 aa  85.9  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192265  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 210 aa  84.3  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.57 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
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NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  27.57 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2189  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2355  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1233  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0636137  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283926 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3137  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4571  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  31.11 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1394  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 214 aa  77.8  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 193 aa  77.8  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0948  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.627177  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1013  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1181  transcriptional regulator, TetR family  24.46 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000215765  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2721  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.236108  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0419  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00785696  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133761 
 
 
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NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_2260  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0561114  normal  0.813784 
 
 
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NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  31.72 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
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NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_8807  putative transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_1620  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135802  normal  1 
 
 
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NC_007925  RPC_1901  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.665453  normal  1 
 
 
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NC_007908  Rfer_3140  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137738  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_5542  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 194 aa  72  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789571  normal  0.111085 
 
 
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NC_009456  VC0395_0530  hypothetical protein  27.13 
 
 		 198 aa  72  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3310  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0639272  normal  1 
 
 
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NC_013169  Ksed_08040  transcriptional regulator  33.53 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009831  Ssed_3643  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256948 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1228  TetR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010506  Swoo_4056  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_4180  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0804485  normal  1 
 
 
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NC_008700  Sama_2408  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009456  VC0395_0238  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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