More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6285 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_6453  TetR family transcriptional regulator  99.49 
 
 		 198 aa  390  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6285  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  390  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6688  TetR family transcriptional regulator  99.49 
 
 		 198 aa  390  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  47.21 
 
 		 218 aa  155  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  39.27 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 216 aa  145  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 201 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 201 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  41.84 
 
 		 206 aa  127  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 208 aa  124  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 205 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 192 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2762  transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 		 207 aa  118  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.598965  normal  0.857853 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 194 aa  111  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3753  TetR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 209 aa  108  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2210  TetR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 185 aa  107  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 207 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2508  transcriptional regulator, TetR family  40.46 
 
 		 206 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 198 aa  104  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 193 aa  99  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0145  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 202 aa  96.3  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.437687  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 192 aa  95.9  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 206 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 156 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0419  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 217 aa  93.2  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00785696  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  31.98 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3310  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0639272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 219 aa  92.8  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556415 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 193 aa  92.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 211 aa  92.4  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0959  transcriptional regulator, TetR family  36.16 
 
 		 219 aa  91.7  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0839  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 203 aa  91.3  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 236 aa  91.3  9e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 236 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.77 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  30.77 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 211 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6901  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165859 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1233  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 236 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0636137  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1394  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 214 aa  89  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 222 aa  89  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 210 aa  89  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283926 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  32.97 
 
 		 195 aa  89  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 204 aa  88.2  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0106  transcriptional regulator, TetR family  44.8 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.431172  normal  0.200565 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2692  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0833  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 182 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0851  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 182 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 197 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3643  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 193 aa  85.5  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5842  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 188 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25935  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6698  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 193 aa  84.7  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1395  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  84.7  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1418  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2964  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0240167  normal  0.157932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3927  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.375374  normal  0.0268365 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3140  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.263348  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3244  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2189  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010506  Swoo_4056  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_2260  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0561114  normal  0.813784 
 
 
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NC_009665  Shew185_1379  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_4123  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_3137  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_0493  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0117598 
 
 
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NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
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NC_010506  Swoo_3433  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  normal  1 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_2694  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357406 
 
 
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NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_26140  putative transcriptional regulator  35.2 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287141  normal  0.149256 
 
 
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