More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2189 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2189  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  408  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0493  transcriptional regulator, TetR family  47.72 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0117598 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0419  transcriptional regulator, TetR family  46.32 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00785696  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 193 aa  116  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 226 aa  104  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 211 aa  99  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 		 193 aa  95.9  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 219 aa  93.2  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 196 aa  89.7  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1179  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 198 aa  89  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288888  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3212  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 193 aa  87.8  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5500  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  decreased coverage  0.000153945 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3254  TetR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3535  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4611  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 371 aa  81.6  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 195 aa  81.3  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5345  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.922777  normal  0.179588 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4357  regulatory protein TetR  29.85 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0319  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33680  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2903  transcriptional regulator of TetR family protein  26.53 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.453644  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  30.57 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  30 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
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NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4180  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0804485  normal  1 
 
 
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NC_011313  VSAL_II0224  transcriptional regulator, TetR-family  26.46 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1087  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00014413  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6901  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165859 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6453  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6285  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6688  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1681  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0293  TetR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000668888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4399  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1901  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.665453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133761 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  37.6 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2210  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2598  hypothetical protein  39.74 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5169  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 193 aa  72  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 193 aa  72  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 193 aa  72  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4679  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.136213 
 
 
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NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
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NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
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NC_013131  Caci_2779  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192265  normal  1 
 
 
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NC_013169  Ksed_08040  transcriptional regulator  32.54 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_2762  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.598965  normal  0.857853 
 
 
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NC_007643  Rru_A0145  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.437687  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_2508  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3310  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0639272  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal  1 
 
 
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NC_009620  Smed_3676  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508637  decreased coverage  0.00105541 
 
 
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NC_007204  Psyc_1395  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0418723  normal  0.76235 
 
 
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NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
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NC_007802  Jann_2631  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0870793 
 
 
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NC_008060  Bcen_1774  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_25370  transcriptional regulator  39.52 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.422708  normal  0.650807 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_2386  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
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