More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7235 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  413  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  86.81 
 
 		 204 aa  330  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  57.22 
 
 		 207 aa  221  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 200 aa  212  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  50.52 
 
 		 197 aa  198  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  50.78 
 
 		 196 aa  195  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2355  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 201 aa  135  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 215 aa  127  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  36.98 
 
 		 193 aa  115  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 156 aa  114  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 198 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 212 aa  111  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 193 aa  108  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 194 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 212 aa  105  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 196 aa  102  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 196 aa  102  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 218 aa  102  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 193 aa  101  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2729  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 211 aa  99.8  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1578  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 203 aa  98.2  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2973  regulatory protein, TetR  48.89 
 
 		 102 aa  98.2  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25370  transcriptional regulator  35.96 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.422708  normal  0.650807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 192 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2692  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  36.31 
 
 		 195 aa  97.1  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0493  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0117598 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0110  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 193 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3433  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26140  putative transcriptional regulator  33.7 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287141  normal  0.149256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3410  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 192 aa  92.8  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1179  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 198 aa  92.4  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288888  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 193 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1181  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 191 aa  92  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000215765  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0948  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 191 aa  91.7  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.627177  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3535  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 191 aa  91.7  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1013  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 191 aa  91.7  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 196 aa  91.7  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4611  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 371 aa  91.7  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 205 aa  91.3  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2694  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 203 aa  91.7  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357406 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0375  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 202 aa  91.3  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00856394  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2631  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 197 aa  91.3  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 205 aa  90.5  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0530  hypothetical protein  31.79 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2762  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 203 aa  89.4  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2864  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037684 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0178  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 203 aa  88.6  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 193 aa  87.8  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4123  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5330  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.733819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1087  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 222 aa  86.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00014413  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3554  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 217 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2779  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 219 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08040  transcriptional regulator  34.41 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1157  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0419  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00785696  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0839  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 203 aa  85.9  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  32.58 
 
 		 203 aa  85.5  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12083  transcriptional regulator, TetR family protein  27.37 
 
 		 187 aa  85.5  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1228  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 193 aa  84.7  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4612  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  84.7  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1158  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 193 aa  84.7  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1229  regulatory protein, TetR  26.14 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1395  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3393  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0969  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6698  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0959  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5500  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  decreased coverage  0.000153945 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2227  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5345  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.922777  normal  0.179588 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2964  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0240167  normal  0.157932 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1396  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>