More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0178 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_0178  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
203 aa  409  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0839  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0959  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 
219 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783426  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
226 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
205 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  43.17 
 
 
216 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  41.73 
 
 
212 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6901  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.165859 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
195 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 
195 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  31.77 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4123  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
204 aa  92  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
206 aa  92  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 
196 aa  91.7  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 
206 aa  91.3  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 
197 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3984  transcriptional regulator, TetR family protein  31.79 
 
 
211 aa  90.9  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2727  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 
213 aa  90.9  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0989177  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
196 aa  89.7  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
204 aa  89  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
218 aa  87  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0960  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
219 aa  87  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.115896  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
211 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 
207 aa  85.9  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2779  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 
200 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192265  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 
207 aa  85.9  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 
211 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 
206 aa  85.9  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 
211 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 
207 aa  85.9  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
214 aa  85.9  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
193 aa  85.9  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
193 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  35.75 
 
 
198 aa  84.7  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
210 aa  84  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0097  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5542  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789571  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3254  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
224 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
213 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 
213 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 
213 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3140  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.263348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3137  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
222 aa  81.6  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 
194 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3418  regulatory protein TetR  35.11 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  0.510685 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3310  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 
205 aa  79  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0639272  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3140  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137738  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3046  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3330  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 
219 aa  78.6  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  36.43 
 
 
193 aa  78.6  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4679  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
193 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.136213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5345  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 
198 aa  78.2  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.922777  normal  0.179588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  34.42 
 
 
198 aa  77.8  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2906  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0722139  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.054525 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00556415 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0293  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000668888 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1394  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  33.6 
 
 
192 aa  77.8  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33680  transcriptional regulator  44.44 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737103  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2260  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
214 aa  77  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0561114  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1620  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135802  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3244  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0904  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0824382  normal  0.0227277 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2619  TetR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.362845  normal  0.246457 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1774  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2386  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  35.77 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2298  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 
219 aa  75.1  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000283926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0833  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0851  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45674  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.94 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0319  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
194 aa  74.7  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 
236 aa  74.7  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 
236 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
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NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  32.19 
 
 
204 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  26.94 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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