236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2619 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2619  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  396  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.362845  normal  0.246457 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1089  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0097  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3433  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25370  transcriptional regulator  29.51 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.422708  normal  0.650807 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0178  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1418  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1395  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2729  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1578  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1379  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2181  regulatory protein TetR  29.38 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  37.21 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0530  hypothetical protein  28.57 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2964  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0240167  normal  0.157932 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05594  transcriptional regulator  28.78 
 
 		 191 aa  72  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2694  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357406 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000004  transcriptional regulator  28.78 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2864  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037684 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2762  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  24.49 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12083  transcriptional regulator, TetR family protein  25.64 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2210  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2631  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6901  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 229 aa  64.7  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165859 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3254  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 204 aa  62  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3140  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137738  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 196 aa  62  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3535  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0375  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00856394  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1681  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4612  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5058  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4611  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4679  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.136213 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0293  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000668888 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2692  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3410  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208492  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6285  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  25.71 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6453  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4123  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_8807  putative transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6688  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3676  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508637  decreased coverage  0.00105541 
 
 
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NC_013132  Cpin_5500  transcriptional regulator, TetR family  29.92 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  decreased coverage  0.000153945 
 
 
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NC_010084  Bmul_0904  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0824382  normal  0.0227277 
 
 
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NC_012850  Rleg_3554  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 217 aa  57.8  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010172  Mext_3418  regulatory protein TetR  32.12 
 
 		 222 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  0.510685 
 
 
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NC_013174  Jden_0106  transcriptional regulator, TetR family  26.57 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.431172  normal  0.200565 
 
 
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NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
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NC_007802  Jann_2012  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.182614 
 
 
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NC_008060  Bcen_1774  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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