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for query gene Cpin_4302 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 192 aa  396  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 193 aa  159  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  40.84 
 
 		 192 aa  150  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 215 aa  144  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 193 aa  143  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 193 aa  137  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 193 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 193 aa  122  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 156 aa  118  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  36.98 
 
 		 219 aa  117  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 193 aa  115  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 193 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1179  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 198 aa  111  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288888  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3410  transcriptional regulator, TetR family  36.75 
 
 		 192 aa  110  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 222 aa  108  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4357  regulatory protein TetR  29.47 
 
 		 201 aa  104  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 204 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3254  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4180  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0804485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 193 aa  102  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 212 aa  101  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 196 aa  101  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2260  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 214 aa  101  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0561114  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 216 aa  100  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3573  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0355911  normal  0.084172 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  31.96 
 
 		 203 aa  99.8  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4056  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 206 aa  98.2  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 195 aa  98.2  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 194 aa  97.8  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2692  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 193 aa  97.1  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1396  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3643  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256948 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1901  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 201 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.665453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 206 aa  96.3  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 207 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 207 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 207 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 210 aa  95.5  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 226 aa  95.5  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 193 aa  95.5  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 206 aa  95.5  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 217 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.054525 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 191 aa  94.7  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 214 aa  94.7  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3927  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.375374  normal  0.0268365 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2227  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 209 aa  93.6  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 213 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3046  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 199 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26140  putative transcriptional regulator  29.1 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287141  normal  0.149256 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4399  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 200 aa  92.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3244  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 221 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  28.16 
 
 		 198 aa  92.4  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 213 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 213 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5500  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 190 aa  91.3  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  decreased coverage  0.000153945 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 211 aa  90.9  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2298  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 219 aa  90.9  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 211 aa  91.3  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 211 aa  91.3  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 211 aa  91.3  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1181  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000215765  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4123  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 204 aa  90.5  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0948  TetR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 191 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.627177  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1013  TetR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 191 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 194 aa  89.4  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0319  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 194 aa  89.4  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 198 aa  89.4  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 211 aa  89.4  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 194 aa  89  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.707616 
 
 
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NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 200 aa  89  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
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NC_013595  Sros_8807  putative transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 211 aa  89  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011891  A2cp1_3330  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 219 aa  88.2  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010172  Mext_3418  regulatory protein TetR  27.84 
 
 		 222 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  0.510685 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 198 aa  87.8  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_2408  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 192 aa  87.8  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 195 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_3140  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 221 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.263348  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
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NC_009620  Smed_3676  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 207 aa  86.3  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508637  decreased coverage  0.00105541 
 
 
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NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 202 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133761 
 
 
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