More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2332 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 193 aa  397  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 193 aa  125  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 192 aa  102  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 204 aa  101  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 194 aa  99.8  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 198 aa  99.8  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 215 aa  98.2  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5330  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.733819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 193 aa  94.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 193 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 192 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3254  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 224 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1478  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.182244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  27.43 
 
 		 195 aa  92.8  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 213 aa  92  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 196 aa  92  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4144  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 188 aa  92  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188303  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3535  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 191 aa  92  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3672  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 188 aa  92  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1181  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 191 aa  91.3  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000215765  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 213 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 213 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0948  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.627177  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4611  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 371 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1013  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 198 aa  89.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3554  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 217 aa  89.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 205 aa  87.8  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 193 aa  87.8  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2692  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 193 aa  87.8  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 200 aa  87  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4399  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 200 aa  87  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 195 aa  87  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 156 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 193 aa  86.3  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1179  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 198 aa  85.5  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288888  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 206 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 193 aa  85.1  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  29.5 
 
 		 203 aa  85.1  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2694  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 203 aa  84.7  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357406 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2260  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0561114  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2762  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_2906  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0722139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3410  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4123  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1578  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6901  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165859 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1379  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3573  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 195 aa  80.9  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0355911  normal  0.084172 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2012  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.182614 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1395  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2864  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037684 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0224  transcriptional regulator, TetR-family  25.39 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4679  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.136213 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1395  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0418723  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3433  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2631  TetR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0969  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021423 
 
 
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NC_011663  Sbal223_2964  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0240167  normal  0.157932 
 
 
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NC_009997  Sbal195_1418  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011891  A2cp1_3330  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_2355  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
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NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  30.21 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
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NC_009092  Shew_2729  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
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NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133761 
 
 
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NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011145  AnaeK_3244  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_5500  transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  decreased coverage  0.000153945 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
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NC_007925  RPC_1901  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.665453  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B3093  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0252517 
 
 
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NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  21.47 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_2545  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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