More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2012 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



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E-value
Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2012  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  400  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.182614 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2692  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 193 aa  92  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 193 aa  85.5  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  28.04 
 
 		 198 aa  84.7  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  29.84 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5058  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2408  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2631  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 205 aa  72  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  30.4 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0106  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.431172  normal  0.200565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2906  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0722139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0948  TetR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.627177  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1013  TetR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1181  transcriptional regulator, TetR family  24.65 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000215765  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0097  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  25.35 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25370  transcriptional regulator  28 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.422708  normal  0.650807 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000004  transcriptional regulator  27.86 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05594  transcriptional regulator  29.6 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1418  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0375  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00856394  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1089  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.631868 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.78 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  27.78 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283926 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4679  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.136213 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0110  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556415 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6698  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3410  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1395  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0796  TetR family transcriptional regulator  21.83 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.091153  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2964  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0240167  normal  0.157932 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1233  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0636137  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0419  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00785696  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3704  transcriptional regulator, TetR family  22.29 
 
 		 190 aa  62  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.21281 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1379  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 193 aa  62  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0530  hypothetical protein  29.08 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5542  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789571  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0293  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000668888 
 
 
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NC_013132  Cpin_3573  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0355911  normal  0.084172 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3212  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
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NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008255  CHU_0252  TetR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.867584  normal  1 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
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NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
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NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
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NC_007204  Psyc_1395  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0418723  normal  0.76235 
 
 
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NC_013093  Amir_4399  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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