More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05594 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05594  transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  390  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000004  transcriptional regulator  97.38 
 
 		 191 aa  383  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0530  hypothetical protein  60.85 
 
 		 198 aa  236  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2864  TetR family transcriptional regulator  47.03 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037684 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1578  TetR family transcriptional regulator  47.03 
 
 		 203 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2964  transcriptional regulator, TetR family  45.95 
 
 		 195 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0240167  normal  0.157932 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1418  TetR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 196 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1379  TetR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 196 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1395  TetR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 196 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2762  TetR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 203 aa  168  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2694  TetR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357406 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2729  TetR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 196 aa  155  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1089  TetR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 190 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3433  TetR family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 193 aa  148  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 192 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 194 aa  88.2  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 193 aa  85.5  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 207 aa  84.7  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 193 aa  84.3  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0293  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000668888 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5169  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3573  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0355911  normal  0.084172 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5500  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  decreased coverage  0.000153945 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 205 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3676  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508637  decreased coverage  0.00105541 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0419  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00785696  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2227  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  38.39 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4144  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188303  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4679  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.136213 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0493  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 206 aa  77.8  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3672  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1681  TetR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3418  regulatory protein TetR  43.02 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  0.510685 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3410  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5750  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0412881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1087  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00014413  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2692  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0904  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0824382  normal  0.0227277 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2619  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 194 aa  72  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.362845  normal  0.246457 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0208  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 199 aa  72  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.41994  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2298  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3554  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 198 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1774  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_2386  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  29.71 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
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NC_009832  Spro_1394  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_5058  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
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NC_009664  Krad_0375  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00856394  normal  0.419772 
 
 
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NC_009621  Smed_5330  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.733819 
 
 
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NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_0097  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  45.16 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
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NC_012857  Rpic12D_3535  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_2906  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0722139  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
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NC_008786  Veis_0960  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.115896  normal  1 
 
 
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