More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5717 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 156 aa  326  6e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 197 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 207 aa  124  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 193 aa  120  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 192 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 215 aa  116  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 196 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 204 aa  114  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  36.91 
 
 		 193 aa  114  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 200 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2692  TetR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 193 aa  111  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 193 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 193 aa  110  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 193 aa  110  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 218 aa  110  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 192 aa  110  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 222 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0948  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 191 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.627177  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1013  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 191 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1181  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 191 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000215765  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 196 aa  100  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 196 aa  100  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 205 aa  100  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 191 aa  100  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 193 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 193 aa  97.4  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 216 aa  96.7  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  33.79 
 
 		 212 aa  95.5  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5542  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 194 aa  94.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789571  normal  0.111085 
 
 
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NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 193 aa  92.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
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NC_013037  Dfer_3410  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 192 aa  92.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4679  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 193 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.136213 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 205 aa  91.7  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 193 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  30.87 
 
 		 193 aa  89.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3535  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 191 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 206 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 206 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25370  transcriptional regulator  35 
 
 		 204 aa  89  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.422708  normal  0.650807 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4611  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 371 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  35.57 
 
 		 203 aa  88.6  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
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NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  88.2  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_004347  SO_1578  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 203 aa  87.4  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_0293  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 203 aa  87  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000668888 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3554  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 217 aa  87  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 206 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2729  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 196 aa  85.9  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 194 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2631  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 197 aa  86.3  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 196 aa  86.3  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 194 aa  85.9  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2906  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 205 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0722139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 193 aa  86.3  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0530  hypothetical protein  34.9 
 
 		 198 aa  85.9  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 214 aa  85.5  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 206 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 207 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 207 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  31.29 
 
 		 195 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3573  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 195 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0355911  normal  0.084172 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 207 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1089  TetR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 190 aa  85.1  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12083  transcriptional regulator, TetR family protein  32.88 
 
 		 187 aa  84.7  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 198 aa  85.1  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0110  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 193 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1774  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 207 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2386  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 207 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 195 aa  84.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0106  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 192 aa  84  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.431172  normal  0.200565 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  30.95 
 
 		 198 aa  83.6  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0097  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000004  transcriptional regulator  38.39 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2694  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357406 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2355  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 198 aa  80.9  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3254  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 224 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 193 aa  80.5  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 204 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 213 aa  80.5  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 213 aa  80.5  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05594  transcriptional regulator  38.39 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_5500  transcriptional regulator, TetR family  34.93 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  decreased coverage  0.000153945 
 
 
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NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
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NC_009052  Sbal_1395  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
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NC_010506  Swoo_3433  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_3137  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_1681  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_3244  transcriptional regulator, TetR family  37.07 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_8807  putative transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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