More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0160 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 193 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  55.73 
 
 		 192 aa  212  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  54.5 
 
 		 193 aa  194  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  53.65 
 
 		 193 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3433  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 193 aa  128  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 193 aa  119  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 194 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1578  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 203 aa  114  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2694  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 203 aa  108  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357406 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 218 aa  105  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 211 aa  105  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 195 aa  104  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2762  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 203 aa  104  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1418  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 216 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 212 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2964  transcriptional regulator, TetR family  34.24 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0240167  normal  0.157932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1395  TetR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2864  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 203 aa  101  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037684 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 211 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 211 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1901  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 201 aa  98.6  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.665453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 207 aa  98.2  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 193 aa  98.2  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 207 aa  98.2  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 207 aa  98.2  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 217 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.054525 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 206 aa  98.2  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000004  transcriptional regulator  33.52 
 
 		 191 aa  98.2  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 214 aa  97.8  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 210 aa  97.1  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1379  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4180  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 204 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0804485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05594  transcriptional regulator  34.5 
 
 		 191 aa  97.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1089  TetR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 190 aa  97.4  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.631868 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 210 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2729  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 196 aa  96.3  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 206 aa  96.3  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 206 aa  96.3  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1394  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 214 aa  95.9  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3093  TetR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 201 aa  95.5  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0252517 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 193 aa  95.5  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4357  regulatory protein TetR  32.14 
 
 		 201 aa  94.7  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 206 aa  95.1  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133761 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 210 aa  94.7  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283926 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0530  hypothetical protein  34.3 
 
 		 198 aa  94.7  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  31.86 
 
 		 203 aa  94.4  8e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2260  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 214 aa  94.4  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0561114  normal  0.813784 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.28 
 
 		 210 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 236 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 210 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 236 aa  93.2  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  32.28 
 
 		 210 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556415 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1233  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 236 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0636137  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3046  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 199 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5345  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 198 aa  92  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.922777  normal  0.179588 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3984  transcriptional regulator, TetR family protein  28.82 
 
 		 211 aa  92  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 211 aa  91.3  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3254  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 224 aa  90.9  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0110  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3753  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 207 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1620  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 205 aa  89  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5058  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 195 aa  88.6  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 198 aa  87  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6285  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6453  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6688  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1253  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 210 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 193 aa  86.3  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4399  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 200 aa  85.1  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3554  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 217 aa  84.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 196 aa  84.7  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
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NC_008740  Maqu_0143  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 202 aa  84.7  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_3310  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 205 aa  84.3  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0639272  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_2692  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  84.3  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
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NC_004347  SO_3393  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_0084  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.382504  normal  0.519853 
 
 
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NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
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