More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0143 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0143  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  419  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0969  TetR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 202 aa  151  7e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021423 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1395  TetR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0418723  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0224  transcriptional regulator, TetR-family  39.27 
 
 		 192 aa  143  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2903  transcriptional regulator of TetR family protein  38.02 
 
 		 196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.453644  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3670  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.411004  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1841  transcriptional regulator, TetR family protein  37.93 
 
 		 195 aa  115  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1396  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 193 aa  104  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26140  putative transcriptional regulator  36.47 
 
 		 196 aa  101  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287141  normal  0.149256 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02226  transcriptional regulator, TetR family protein  32.35 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.972925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 192 aa  91.7  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 193 aa  91.7  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4180  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 204 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0804485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3046  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1088  transcriptional regulator, TetR family protein  30.68 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1292  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3643  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256948 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0238  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 191 aa  89.4  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3704  transcriptional regulator, TetR family  37.59 
 
 		 190 aa  89  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.21281 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1774  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 207 aa  88.2  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2386  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 207 aa  88.2  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1248  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 193 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4357  regulatory protein TetR  31.22 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1229  regulatory protein, TetR  29.53 
 
 		 235 aa  86.7  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4056  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3062  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 193 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000497782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.054525 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1326  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 193 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0115046 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2721  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 193 aa  85.5  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.236108  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1228  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 193 aa  85.5  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 204 aa  85.1  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1157  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 193 aa  84.7  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 195 aa  84.7  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 193 aa  84.7  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3393  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2906  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0722139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1087  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00014413  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2816  transcriptional regulator, TetR family protein  34.25 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2227  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4571  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 199 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3676  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508637  decreased coverage  0.00105541 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1253  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5169  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0493  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0117598 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1158  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3093  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0252517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2779  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133761 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3099  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0620  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0960  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.115896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3554  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3140  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8807  putative transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3927  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.375374  normal  0.0268365 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3984  transcriptional regulator, TetR family protein  26.2 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3254  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5750  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0412881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2729  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0120  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.555065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2694  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357406 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2545  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1478  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.182244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0948  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.627177  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1013  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0904  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0824382  normal  0.0227277 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2391  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640544  normal  0.528893 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1181  transcriptional regulator, TetR family  24.22 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000215765  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0530  hypothetical protein  29.47 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2762  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5116  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3310  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0639272  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>