More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3062 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3062  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 193 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000497782 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1326  TetR family transcriptional regulator  98.45 
 
 		 193 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0115046 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1292  TetR family transcriptional regulator  96.89 
 
 		 193 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1248  TetR family transcriptional regulator  97.41 
 
 		 193 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2721  TetR family transcriptional regulator  79.69 
 
 		 193 aa  323  1e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.236108  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_1157  TetR family transcriptional regulator  77.72 
 
 		 193 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1228  TetR family transcriptional regulator  77.2 
 
 		 193 aa  311  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1158  TetR family transcriptional regulator  76.56 
 
 		 193 aa  304  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3393  TetR family transcriptional regulator  74.61 
 
 		 193 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4056  TetR family transcriptional regulator  63.54 
 
 		 193 aa  264  7e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3643  TetR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 193 aa  257  6e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256948 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1396  TetR family transcriptional regulator  61.26 
 
 		 193 aa  253  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3099  TetR family transcriptional regulator  60.94 
 
 		 192 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2408  TetR family transcriptional regulator  58.85 
 
 		 192 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1229  regulatory protein, TetR  59.69 
 
 		 235 aa  228  4e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1088  transcriptional regulator, TetR family protein  60.77 
 
 		 198 aa  228  4e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0238  TetR family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 191 aa  185  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3704  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 190 aa  90.5  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.21281 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 193 aa  88.2  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2903  transcriptional regulator of TetR family protein  28.26 
 
 		 196 aa  87.8  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.453644  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0143  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 202 aa  86.3  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 196 aa  85.9  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 196 aa  85.9  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1841  transcriptional regulator, TetR family protein  25 
 
 		 195 aa  84.7  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3670  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 197 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.411004  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1395  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0418723  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
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NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
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NC_007643  Rru_A0145  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.437687  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2816  transcriptional regulator, TetR family protein  30.32 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  24.47 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0969  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021423 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0224  transcriptional regulator, TetR-family  24.74 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_2545  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
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NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4571  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_0293  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 203 aa  72  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000668888 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  27.78 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3093  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0252517 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3927  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.375374  normal  0.0268365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0948  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.627177  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1013  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1181  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000215765  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1681  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  25.14 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3672  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1253  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4144  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188303  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1394  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.98 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  26.98 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
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NC_013595  Sros_8807  putative transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_2906  transcriptional regulator, TetR family  24.66 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0722139  normal  1 
 
 
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NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_0110  transcriptional regulator, TetR family  55 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008345  Sfri_3984  transcriptional regulator, TetR family protein  25.79 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283926 
 
 
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NC_008048  Sala_2692  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
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NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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