More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0969 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0969  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  407  1e-113  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021423 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1395  TetR family transcriptional regulator  83.66 
 
 		 202 aa  345  3e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0418723  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2903  transcriptional regulator of TetR family protein  39.36 
 
 		 196 aa  155  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.453644  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0224  transcriptional regulator, TetR-family  40.93 
 
 		 192 aa  153  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0143  TetR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 202 aa  151  7e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1841  transcriptional regulator, TetR family protein  42.46 
 
 		 195 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3670  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.411004  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02226  transcriptional regulator, TetR family protein  36.36 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.972925  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2355  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 201 aa  91.3  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 194 aa  89.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3704  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 190 aa  86.3  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.21281 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3643  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 193 aa  85.9  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256948 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0238  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 191 aa  85.5  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  85.1  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1229  regulatory protein, TetR  29.57 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.054525 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3099  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3433  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4180  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0804485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4056  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 196 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 196 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1379  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2631  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4357  regulatory protein TetR  31.38 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3410  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5500  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  decreased coverage  0.000153945 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2408  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1418  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 193 aa  77.8  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3046  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1395  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1396  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0145  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.437687  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3062  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000497782 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12083  transcriptional regulator, TetR family protein  25.6 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2964  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0240167  normal  0.157932 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1901  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.665453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1248  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2721  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.236108  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2762  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1578  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1326  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0115046 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1088  transcriptional regulator, TetR family protein  32.16 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2864  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 203 aa  72  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037684 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 206 aa  72  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3573  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 195 aa  72  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0355911  normal  0.084172 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4679  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 193 aa  72  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.136213 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4399  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1292  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2694  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357406 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2729  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
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NC_011369  Rleg2_0110  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0530  hypothetical protein  31.07 
 
 		 198 aa  71.2  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0419  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00785696  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_3254  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1157  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_6698  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_2779  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192265  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
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NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
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NC_013521  Sked_25370  transcriptional regulator  31.01 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.422708  normal  0.650807 
 
 
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NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_2906  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0722139  normal  1 
 
 
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NC_013457  VEA_000004  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_1087  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00014413  n/a   
 
 
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