More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1209 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  380  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  71.88 
 
 		 193 aa  281  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  63.54 
 
 		 192 aa  251  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  54.5 
 
 		 193 aa  194  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 205 aa  137  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 192 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 193 aa  128  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 219 aa  125  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  38.66 
 
 		 198 aa  125  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 194 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 193 aa  122  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1578  TetR family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 193 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 211 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3433  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 193 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2694  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 203 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 206 aa  115  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2762  TetR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 203 aa  115  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 193 aa  114  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5345  TetR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 198 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.922777  normal  0.179588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 222 aa  114  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 195 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1089  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2864  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 203 aa  111  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037684 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 216 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 213 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 213 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 213 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3573  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0355911  normal  0.084172 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1395  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2964  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0240167  normal  0.157932 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5058  transcriptional regulator, TetR family  39.79 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1379  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 196 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 156 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3554  transcriptional regulator, TetR family  36.98 
 
 		 217 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1418  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 196 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 211 aa  105  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 194 aa  104  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3410  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 192 aa  104  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  38.22 
 
 		 194 aa  104  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  32.11 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.16 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 236 aa  102  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 236 aa  102  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  33.16 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0530  hypothetical protein  34.1 
 
 		 198 aa  102  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 204 aa  101  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556415 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000004  transcriptional regulator  33.14 
 
 		 191 aa  101  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1233  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 236 aa  101  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0636137  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283926 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6453  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6688  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  36.9 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3310  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 205 aa  99.8  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0639272  normal  1 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6285  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42646  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_2692  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 193 aa  99  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
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NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  35.26 
 
 		 195 aa  99.4  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 195 aa  99  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_5500  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 190 aa  99  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  decreased coverage  0.000153945 
 
 
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NC_010581  Bind_1478  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 188 aa  98.6  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.182244  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_1394  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 214 aa  98.2  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 208 aa  98.2  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010002  Daci_3927  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 208 aa  97.8  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.375374  normal  0.0268365 
 
 
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NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  32.12 
 
 		 203 aa  97.8  9e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
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NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 207 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 207 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_2545  TetR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_2260  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 214 aa  97.1  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0561114  normal  0.813784 
 
 
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NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 207 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009784  VIBHAR_05594  transcriptional regulator  32 
 
 		 191 aa  97.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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