More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_25370 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_25370  transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  400  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.422708  normal  0.650807 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0106  transcriptional regulator, TetR family  43.68 
 
 		 192 aa  162  4.0000000000000004e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.431172  normal  0.200565 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0375  transcriptional regulator, TetR family  46.37 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00856394  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4612  transcriptional regulator, TetR family  43.72 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2181  regulatory protein TetR  39.89 
 
 		 191 aa  137  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 207 aa  95.9  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 200 aa  96.3  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 213 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 213 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 196 aa  94.7  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 196 aa  94.7  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 213 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 196 aa  94.4  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0110  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 204 aa  91.7  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 156 aa  89  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  34.3 
 
 		 198 aa  87  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 193 aa  85.9  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 193 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 193 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 218 aa  84.7  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2631  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0948  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.627177  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1013  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1181  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000215765  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  37.01 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33680  transcriptional regulator  44.64 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1774  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2386  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 192 aa  77.8  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
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NC_008463  PA14_26140  putative transcriptional regulator  35.2 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287141  normal  0.149256 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1087  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00014413  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4123  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_0419  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00785696  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2619  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.362845  normal  0.246457 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  33.7 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1179  transcriptional regulator, TetR family  34.42 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288888  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0293  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000668888 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0959  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3433  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1681  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12083  transcriptional regulator, TetR family protein  27.91 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0904  TetR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0824382  normal  0.0227277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133761 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3310  transcriptional regulator, TetR family  57.38 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0639272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 210 aa  72  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.58 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5058  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010172  Mext_4357  regulatory protein TetR  40.54 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  32.58 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.054525 
 
 
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NC_012850  Rleg_1253  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
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NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283926 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 216 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2727  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0989177  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_5345  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.922777  normal  0.179588 
 
 
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NC_010725  Mpop_4180  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0804485  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  30.77 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal  1 
 
 
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NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556415 
 
 
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