More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0375 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0375  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  390  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00856394  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4612  transcriptional regulator, TetR family  56.02 
 
 		 196 aa  189  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0106  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 192 aa  181  5.0000000000000004e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.431172  normal  0.200565 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2181  regulatory protein TetR  48.69 
 
 		 191 aa  165  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25370  transcriptional regulator  46.37 
 
 		 204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.422708  normal  0.650807 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 204 aa  91.7  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 193 aa  77.8  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0833  TetR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0851  TetR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5058  transcriptional regulator, TetR family  35.77 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3433  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33680  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0530  hypothetical protein  28.74 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0851  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  29.5 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3310  transcriptional regulator, TetR family  39.04 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0639272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1179  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288888  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2729  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0110  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 193 aa  72  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4571  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003910  CPS_1681  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 198 aa  71.2  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05594  transcriptional regulator  31.71 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_1089  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3140  TetR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137738  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2298  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5842  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25935  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0904  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0824382  normal  0.0227277 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  30.05 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133761 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  44.12 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0319  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000004  transcriptional regulator  30.08 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  51.61 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2631  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2692  TetR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0493  TetR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3418  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  0.510685 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2012  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.182614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3927  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.375374  normal  0.0268365 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2227  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12083  transcriptional regulator, TetR family protein  25.36 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3554  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1087  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00014413  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_0293  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000668888 
 
 
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NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
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NC_007802  Jann_0097  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_1774  TetR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_2694  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357406 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_2386  TetR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_0959  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783426  normal  1 
 
 
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NC_008577  Shewana3_2864  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037684 
 
 
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NC_009664  Krad_0493  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0117598 
 
 
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