154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2973 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2973  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 102 aa  207  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  91.01 
 
 		 222 aa  165  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  56.38 
 
 		 196 aa  108  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  53.76 
 
 		 197 aa  104  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 207 aa  98.6  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  48.91 
 
 		 204 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 204 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 200 aa  95.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2355  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 201 aa  70.9  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 192 aa  62  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2692  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 193 aa  60.1  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5058  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5500  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  decreased coverage  0.000153945 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 193 aa  57  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4679  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.136213 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4065  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 193 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2779  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 200 aa  53.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 216 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 198 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 192 aa  53.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 212 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  33.67 
 
 		 195 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 193 aa  52.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  31.52 
 
 		 198 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 195 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0948  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 191 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.627177  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1013  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 191 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1181  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 191 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000215765  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 193 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 194 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 191 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2903  transcriptional regulator of TetR family protein  28.72 
 
 		 196 aa  50.4  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.453644  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 218 aa  50.4  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 185 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 201 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 201 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0530  hypothetical protein  46.51 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0375  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 202 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00856394  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 195 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
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NC_010002  Daci_3927  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.375374  normal  0.0268365 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 211 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12083  transcriptional regulator, TetR family protein  30.85 
 
 		 187 aa  48.9  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2059  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 211 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 211 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4399  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0224  transcriptional regulator, TetR-family  32.63 
 
 		 192 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3535  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 191 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2508  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 206 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4611  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 371 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 202 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 193 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3410  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 192 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  29.67 
 
 		 206 aa  47  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3573  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 195 aa  47.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0355911  normal  0.084172 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3254  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 224 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3137  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 197 aa  47  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2181  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 191 aa  47  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3093  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 201 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0252517 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2631  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 197 aa  47  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 193 aa  47  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3433  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 193 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0110  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 193 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1089  TetR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 193 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 211 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
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NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 211 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
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NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 211 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 211 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 211 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
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NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 206 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
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NC_009092  Shew_2729  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 196 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
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NC_011138  MADE_02226  transcriptional regulator, TetR family protein  30.11 
 
 		 196 aa  45.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.972925  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_3069  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 208 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0746648  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_2906  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0722139  normal  1 
 
 
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NC_013174  Jden_0106  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 192 aa  45.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.431172  normal  0.200565 
 
 
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NC_013521  Sked_25370  transcriptional regulator  27.55 
 
 		 204 aa  45.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.422708  normal  0.650807 
 
 
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NC_012560  Avin_35810  Regulatory protein, TetR-family  30.23 
 
 		 183 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_0097  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 213 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
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NC_008322  Shewmr7_2762  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 203 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 213 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 213 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_6901  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 229 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165859 
 
 
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NC_012850  Rleg_0120  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 227 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.555065  normal  1 
 
 
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