More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4804 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 201 aa  397  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 219 aa  88.6  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 212 aa  77.8  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  32.77 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 213 aa  72  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 261 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  36.04 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.04 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.04 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.04 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.04 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.04 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.04 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  36.04 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  32.34 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.68 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.23 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.23 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.23 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3975  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.23 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.23 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.23 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.23 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.14 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.23 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  35.65 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  30.89 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3240  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.55 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.501766  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
-
 
NC_004310  BR0290  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547414  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.62 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0304  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661097  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 205 aa  62  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 217 aa  62  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.46 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 239 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 221 aa  61.2  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  30.06 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  30.06 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  30.06 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  30.06 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  30.06 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  30.06 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  28.81 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  46.77 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0374  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.120665  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18080  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0696  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>