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for query gene Sros_8486 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
201 aa  396  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  73.33 
 
 
210 aa  264  7e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  65.62 
 
 
239 aa  256  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0115  transcriptional regulator, TetR family  58.55 
 
 
199 aa  208  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0465  hypothetical protein  57.45 
 
 
200 aa  197  9e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  43.88 
 
 
212 aa  160  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  47.59 
 
 
204 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 
201 aa  64.7  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 
211 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 
195 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  45.57 
 
 
226 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
195 aa  63.2  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 
192 aa  61.6  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  43.68 
 
 
216 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  33.61 
 
 
234 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 
215 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 
196 aa  59.3  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 
201 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 
238 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
209 aa  58.9  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
198 aa  58.5  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
206 aa  58.2  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
225 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5881  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
197 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 
221 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
212 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
197 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 
212 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 
209 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  34.26 
 
 
206 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  29.81 
 
 
211 aa  55.5  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
221 aa  55.8  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
210 aa  55.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 
192 aa  55.5  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  32.07 
 
 
196 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 
212 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 
222 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
224 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  33.71 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  31.75 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 
205 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 
201 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
228 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 
209 aa  53.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
197 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
206 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 
225 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
197 aa  52.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 
309 aa  52.4  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 
199 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 
216 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
205 aa  52.4  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
213 aa  52  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
214 aa  52  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
224 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
195 aa  52  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
224 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
222 aa  51.6  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  30 
 
 
197 aa  51.6  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
212 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
230 aa  52  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 
242 aa  51.6  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
224 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 
223 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 
224 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
205 aa  51.6  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  45.45 
 
 
237 aa  51.6  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  24.41 
 
 
310 aa  51.2  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 
206 aa  51.2  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
224 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  31.03 
 
 
219 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 
219 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 
263 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  32.35 
 
 
190 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 
197 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
206 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1826  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
250 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0995188  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  39.13 
 
 
198 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
228 aa  50.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  43.64 
 
 
196 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal 
 
 
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NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 
196 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30610  transcriptional regulator  41.38 
 
 
201 aa  51.2  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 
223 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
212 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
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NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 
228 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.414971 
 
 
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NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 
208 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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