More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_24710 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 198 aa  391  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4323  regulatory protein, TetR  43.23 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0245964 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  43.01 
 
 		 194 aa  122  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  42.93 
 
 		 195 aa  122  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4763  TetR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781145  decreased coverage  0.0000189499 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 199 aa  118  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  51.16 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  49.17 
 
 		 214 aa  115  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  38.22 
 
 		 209 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16550  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 207 aa  93.6  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.882037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4678  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 221 aa  91.3  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 204 aa  88.6  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  32.98 
 
 		 204 aa  84.7  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 224 aa  77.8  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4004  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0894492  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2908  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  36.17 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3550  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2273  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 236 aa  72  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 226 aa  71.2  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2892  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5875  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5205  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155344  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5654  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.346197  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4581  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 235 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712688 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3524  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 223 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  36.8 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12926  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.394038 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  29.09 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  28.48 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  28.24 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  28.48 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  28.48 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  28.24 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0925  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  28.48 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  46.03 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 268 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37010  transcriptional regulator  46.38 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0268  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3867  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53155  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  38.03 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  47.54 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 198 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 231 aa  51.6  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 201 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 218 aa  51.2  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4797  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 216 aa  51.2  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00913075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 196 aa  51.2  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  31.96 
 
 		 242 aa  51.2  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.23 
 
 		 216 aa  51.2  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  33.96 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  35 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>