More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1699 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 205 aa  426  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  53.17 
 
 		 213 aa  209  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  47.94 
 
 		 204 aa  187  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  46.84 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 196 aa  121  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4138  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 193 aa  105  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1410  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  32.92 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 192 aa  99.8  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 214 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  30.77 
 
 		 198 aa  95.5  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 196 aa  94.7  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 209 aa  89.4  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 210 aa  89.4  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  31.28 
 
 		 222 aa  89.4  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 212 aa  88.2  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 212 aa  88.2  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 190 aa  87  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 220 aa  85.1  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 212 aa  85.1  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 186 aa  85.1  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  27.98 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
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NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
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NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2969  hypothetical protein  32.8 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448916  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 202 aa  77.8  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  34.06 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
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NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
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NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
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NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010676  Bphyt_4097  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 194 aa  72  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0020  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.390674  normal  0.0209926 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  28.66 
 
 		 209 aa  72  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  26.97 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  29.38 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  22.67 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  24.75 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5102  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
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NC_007778  RPB_4264  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 181 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
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NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  28.42 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
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NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011729  PCC7424_3948  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008345  Sfri_3993  transcriptional regulator, TetR family protein  24.84 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000102791  n/a   
 
 
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NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal  1 
 
 
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