More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3353 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 194 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 193 aa  95.9  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 196 aa  95.5  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 190 aa  95.1  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 196 aa  95.1  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 199 aa  92  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 196 aa  91.7  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 215 aa  91.7  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  26.92 
 
 		 220 aa  91.3  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 191 aa  88.6  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 198 aa  88.6  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 196 aa  88.2  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 193 aa  85.5  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 227 aa  85.5  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 192 aa  84.7  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 196 aa  84.3  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  28.33 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3234  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3487  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.418737  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3462  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00233938  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  29.44 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1013  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
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NC_007323  GBAA_pXO2_0055  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.727514  n/a   
 
 
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NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_006274  BCZK3140  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.404836  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_3208  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000777782  n/a   
 
 
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NC_006578  pBT9727_0042  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_6698  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1893  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3453  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0161587  hitchhiker  4.69207e-17 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
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NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  29.14 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3448  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5004  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0270987  normal  0.0251839 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
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NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  27.27 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
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NC_008345  Sfri_3993  transcriptional regulator, TetR family protein  23.56 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000102791  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
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NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_0892  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397174  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_0881  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.929355 
 
 
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NC_007954  Sden_1229  regulatory protein, TetR  25.7 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_0875  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
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NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 211 aa  72  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
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NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 209 aa  72  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
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NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 219 aa  72  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
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NC_010335  Caul_5102  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  25.54 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  30.99 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
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NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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