More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0268 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  419  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  34.24 
 
 		 201 aa  93.2  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 193 aa  92.8  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 193 aa  91.7  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 205 aa  88.6  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 193 aa  87.8  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  27.36 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  25.75 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  28.8 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  25.39 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  27.55 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3099  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3643  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256948 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  28.74 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  27.38 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  21.98 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 183 aa  67.8  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4056  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1410  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1229  regulatory protein, TetR  25.14 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1329  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  27.96 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
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NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0020  TetR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.390674  normal  0.0209926 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
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NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
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NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
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NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
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NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  24.37 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  25.36 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_1157  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009997  Sbal195_1326  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0115046 
 
 
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NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
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