More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0020 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0020  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 246 aa  499  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.390674  normal  0.0209926 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  51.03 
 
 		 213 aa  198  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  52.33 
 
 		 211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  47.15 
 
 		 205 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 201 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 201 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4097  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1329  transcriptional regulator, TetR family  26.89 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 196 aa  68.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0361  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.23201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3816  TetR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 201 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0181155  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  60.38 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4138  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  29.47 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 196 aa  62  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 204 aa  62  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 206 aa  62  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 197 aa  61.6  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  30.43 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4587  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 227 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5102  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0985  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  31.66 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 195 aa  57  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  47.46 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  21.03 
 
 		 201 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 221 aa  55.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 332 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2575  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 196 aa  55.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.230257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  29.86 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  37.89 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
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NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
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NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  53.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
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NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 195 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
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NC_008463  PA14_48190  putative transcriptional regulator  27.22 
 
 		 186 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114913  normal  0.0538885 
 
 
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NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 201 aa  53.1  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 195 aa  53.1  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
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NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 201 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
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NC_007348  Reut_B4322  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 198 aa  52.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136212  n/a   
 
 
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NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 200 aa  52.8  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
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NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 186 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010571  Oter_2526  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 252 aa  52.8  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
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NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 310 aa  52.8  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 257 aa  52.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
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