More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0059 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  373  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  26.67 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  20.12 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  27.38 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 189 aa  62  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 186 aa  62  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  24.65 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 214 aa  61.2  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  23.26 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  23.16 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  23.08 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5762  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182054  normal  0.0696367 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  22.62 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  20.81 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  20.81 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  20.65 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  20.81 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  20.81 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  20.81 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  20.81 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  20.81 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  20.81 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  20.81 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  21.58 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3816  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0181155  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0020  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 246 aa  58.2  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.390674  normal  0.0209926 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  28.99 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 242 aa  57.8  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  48.94 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2002  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0595533  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 219 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  21.91 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 324 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1567  TetR family transcriptional regulator  21.83 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.246189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>