More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1567 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1567  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  420  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.246189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  60.89 
 
 		 204 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  43.15 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 219 aa  103  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 243 aa  102  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 203 aa  99.4  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 193 aa  91.7  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2740  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 230 aa  90.1  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291953  hitchhiker  0.000390237 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1502  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385487  normal  0.318035 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1427  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.286714  hitchhiker  0.000126282 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1705  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5412  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00435132  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  21.83 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3011  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  48.15 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2016  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5271  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.869889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  25.15 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  34.55 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2892  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  29.47 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  29.47 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1088  transcriptional regulator, TetR family  23.4 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  29.47 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  29.47 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  29.47 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  29.47 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  27.03 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0974  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  23.68 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1137  transcriptional regulator, TetR family  23.94 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1526  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1217  transcriptional regulator, TetR family  23.68 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1515  regulatory protein, TetR  37.08 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  43.55 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1477  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1156  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.813518  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2858  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1480  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1502  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1173  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4114  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3955  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.915843  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0976  regulatory protein TetR  40.91 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00018682  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4434  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  22.41 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2322  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.850071  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>