More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1173 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1173  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  453  1e-127  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0153  TetR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 193 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3699  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 204 aa  191  6e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158617  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5887  TetR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 212 aa  184  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1789  TetR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 210 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  30.96 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0133  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 191 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14044 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  22.34 
 
 		 205 aa  62  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 175 aa  57  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1681  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.977422 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1572  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6735  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6259  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1968  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000902359 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3792  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 179 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1499  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2204  putative transcriptional regulator  42.62 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1638  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.181149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  38.55 
 
 		 181 aa  54.7  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  23.76 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25800  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 388 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 185 aa  54.7  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1534  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.468022 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2292  intercellular adhesion regulator  33.64 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0364892  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3822  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  42.62 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  26.76 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3988  regulatory protein, TetR  24.73 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100564  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1316  transcriptional regulator, TetR family  30.66 
 
 		 298 aa  53.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 335 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 192 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  35.19 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  48 
 
 		 390 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  32.29 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 221 aa  52  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 202 aa  52.4  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 		 193 aa  52.4  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0667  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  52.4  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042492  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  52  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 198 aa  51.6  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 184 aa  52  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  26.05 
 
 		 202 aa  51.6  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2735  TetR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5567  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 290 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 290 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5130  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 290 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  40.26 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 291 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2746  regulatory protein TetR  53.49 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3711  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 420 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336995  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0349  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3728  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 290 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 286 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2689  TetR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3701  transcriptional regulator of TetR family protein  42.59 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>