More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1242 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  433  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  89.15 
 
 		 212 aa  392  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  34.84 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  29.09 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  34.84 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2204  putative transcriptional regulator  29.35 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25800  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1968  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000902359 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3792  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1638  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.181149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 385 aa  58.5  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 286 aa  58.2  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1784  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3822  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1534  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.468022 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  27.53 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1499  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  31.91 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36980  transcriptional regulator  34.83 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1173  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2086  putative transcription regulator protein  30.69 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  26.16 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0938  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 247 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1772  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.706828  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  38.82 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  30.36 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0099  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  hitchhiker  0.000212753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1913  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000580043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 236 aa  52.4  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>