More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6443 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  423  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  40.31 
 
 		 204 aa  151  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  44.38 
 
 		 203 aa  145  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 200 aa  134  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 248 aa  111  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 307 aa  101  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 333 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 214 aa  95.1  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 199 aa  91.7  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 219 aa  91.3  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  34.25 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 208 aa  81.3  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  25.84 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
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NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  25.36 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
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NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  29.89 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  28.98 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  37.01 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
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NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
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NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 225 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
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NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
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NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
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NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  26.55 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
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NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  29.44 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
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NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  24.28 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5095  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.666558  normal  0.638711 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  28.31 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
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NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  24.86 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
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NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
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NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
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NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  27.56 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  24.16 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
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NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
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NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 239 aa  61.2  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
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NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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