More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4757 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 247 aa  495  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 215 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 208 aa  89.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  44.29 
 
 		 202 aa  86.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 214 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 204 aa  85.5  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  52.87 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  50.54 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  37.6 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 223 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  46.59 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  54.17 
 
 		 217 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  39.82 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  53.52 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  49.32 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  46.34 
 
 		 215 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 194 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  43.33 
 
 		 216 aa  67  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  44.32 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  44.87 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  30.74 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  42.35 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  42.55 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  45.13 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  55.56 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  45.57 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  38.74 
 
 		 206 aa  62  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  41 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  50.79 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  48.48 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0450  transcriptional regulator, TetR family  35.65 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.258482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2071  TetR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3564  putative transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.394377 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  35.81 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  35.23 
 
 		 200 aa  57  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3184  TetR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.13539  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4097  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2370  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  48.53 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 497 aa  55.5  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 324 aa  55.5  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  41.96 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 209 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 199 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  31.09 
 
 		 191 aa  54.7  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1784  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12964 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  47.73 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  48.08 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1320  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>