More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5173 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  387  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  69.31 
 
 		 192 aa  265  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  60.42 
 
 		 192 aa  235  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  59.9 
 
 		 192 aa  233  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  59.9 
 
 		 192 aa  233  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  60.66 
 
 		 223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 215 aa  205  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 194 aa  165  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  49.45 
 
 		 191 aa  159  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  44.58 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  35.22 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  52.81 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  38.56 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  50.57 
 
 		 208 aa  81.3  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 212 aa  81.3  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  49.49 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  28.72 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 247 aa  68.2  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  53.23 
 
 		 208 aa  67.8  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  41 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  40.8 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  47.3 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  36.64 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  30.66 
 
 		 236 aa  64.7  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 183 aa  64.3  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  38.05 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  44.05 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  47.3 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 202 aa  62  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  50.68 
 
 		 190 aa  62  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  37.41 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  38.4 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  50.82 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2609  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3184  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.13539  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  45.16 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 210 aa  57.8  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 251 aa  57.8  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  54.39 
 
 		 209 aa  57.8  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  54.39 
 
 		 209 aa  57.8  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  29.63 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  48.53 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 197 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  41.3 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8148  putative transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2071  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3987  regulatory protein TetR  47.76 
 
 		 71 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.934886  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5935  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109466 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  35.71 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  39.08 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>