More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0989 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  391  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13864  TetR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4506  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4593  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10871  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4889  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1676  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 201 aa  115  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5077  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10705  transcriptional regulator  30.21 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3700  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  43.02 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  46.25 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  35.35 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  43.02 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  43.68 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  45.12 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  36.42 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 209 aa  57.8  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  40.22 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0203  regulatory protein TetR  36.65 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.041689  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  40.7 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  30.15 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  42.53 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  41.49 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4347  transcriptional regulator, TetR family  42.68 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  52.73 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3667  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3734  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3807  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225103  normal  0.0640685 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3746  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29443  normal  0.952036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>