262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_04630 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 
216 aa  417  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 
241 aa  91.7  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1121  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.2139 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 
236 aa  72  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1320  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
215 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
247 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 
195 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  52.54 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
200 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 
201 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
211 aa  58.2  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
202 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  26.77 
 
 
216 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
214 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13864  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
209 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 
202 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 
209 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  52.54 
 
 
204 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
198 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 
208 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 
208 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 
230 aa  55.8  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 
237 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 
212 aa  55.1  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 
200 aa  55.1  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
194 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 
188 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
211 aa  53.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
191 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
215 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
191 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
215 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
191 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
215 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
194 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
203 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
217 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 
212 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
196 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 
192 aa  52.4  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 
192 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 
194 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
208 aa  51.6  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 
187 aa  52  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 
213 aa  51.6  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
192 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 
252 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  33.96 
 
 
188 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  40 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
203 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
324 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 
215 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  30.97 
 
 
248 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  38.98 
 
 
211 aa  49.3  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
201 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 
212 aa  49.3  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
210 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2584  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 
198 aa  48.9  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0829  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 
190 aa  48.9  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  45.16 
 
 
210 aa  49.3  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
226 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 
199 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 
199 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 
199 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  42 
 
 
207 aa  48.5  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
215 aa  48.5  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
210 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1676  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
201 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257121  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
207 aa  48.1  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1882  regulatory protein TetR  29.63 
 
 
204 aa  48.1  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 
202 aa  48.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37210  transcriptional regulator  30.52 
 
 
219 aa  48.1  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 
204 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
227 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  27.54 
 
 
220 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
229 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
191 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 
199 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3349  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.545743 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
202 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 
204 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4904  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
289 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 
214 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 
217 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
280 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 
216 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0389  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 
222 aa  46.6  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.245239  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0992  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
197 aa  46.2  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2173  regulatory protein, TetR  40 
 
 
200 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  26.71 
 
 
221 aa  46.6  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  44.19 
 
 
191 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2112  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 
211 aa  46.2  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>