More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1157 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  431  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  64.06 
 
 		 192 aa  249  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  64.62 
 
 		 223 aa  248  7e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  62.84 
 
 		 194 aa  229  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 192 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 192 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  55.73 
 
 		 192 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  50.56 
 
 		 194 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  51.91 
 
 		 191 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 200 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  40.13 
 
 		 202 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  37.28 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  62.71 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  36.42 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  55.93 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  55.93 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  55.93 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  56.45 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  42.47 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  45.57 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2609  transcriptional regulator, TetR family  50.75 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 199 aa  62  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  32.95 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  56.9 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3987  regulatory protein TetR  55.17 
 
 		 71 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.934886  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3184  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.13539  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5935  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109466 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  39.8 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  43.42 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4097  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  44.3 
 
 		 252 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2071  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  52.73 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  52.73 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8148  putative transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  39.39 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  40.32 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5921  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0100  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0488762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 289 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  39.36 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  43.96 
 
 		 205 aa  52.4  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  36.59 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 239 aa  52.4  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  47.62 
 
 		 219 aa  52  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  36.84 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>