More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2460 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 214 aa  423  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  38.68 
 
 		 219 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 229 aa  123  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  41.24 
 
 		 222 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 208 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  40.14 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  40.77 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  41.9 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1662  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  0.0656981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  37.72 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  40.15 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0193  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  62.5 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  50.77 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3564  putative transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.394377 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  43.3 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  45 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3895  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467976  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 246 aa  62  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  44.59 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  52.73 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2398  TetR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.010674  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  43.04 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  30.71 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1320  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  39.66 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 241 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0758  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251208 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1121  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.2139 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  42.17 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  55.1 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  41.1 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  40.26 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  45 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1997  TetR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0474929  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  41.05 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10705  transcriptional regulator  47.37 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>