More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2165 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 215 aa  428  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  48.65 
 
 		 222 aa  148  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  44.51 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  44.97 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 214 aa  111  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1662  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 206 aa  111  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  0.0656981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3564  putative transcriptional regulator, TetR family  39.79 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.394377 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 280 aa  100  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  37.2 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  37.96 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  43.61 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  44.3 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  37.95 
 
 		 208 aa  95.1  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 226 aa  92.8  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0193  transcriptional regulator, TetR family  38.69 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  42.64 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3895  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 204 aa  89  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467976  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 289 aa  81.6  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 192 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  36.77 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  36.97 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  43 
 
 		 247 aa  72  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2398  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.010674  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  46.84 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  41.75 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  43 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  51.56 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  46.58 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  47.67 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  39.37 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  33.76 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2071  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4093  putative transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  29.94 
 
 		 248 aa  62  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06260  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 190 aa  62  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  42.68 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2446  TetR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00126454  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  40.66 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  48.61 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  32 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1862  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3184  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.13539  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  35.61 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  31.2 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  38.2 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  33.54 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>