More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5615 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 206 aa  411  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5762  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182054  normal  0.0696367 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8662  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9036  putative transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.505167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3010  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3745  hypothetical protein  33.49 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239031  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2689  putative transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.559134 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1169  regulatory protein, TetR  29.67 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1039  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 223 aa  62  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  28.14 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5516  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5749  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4596  transcriptional regulator, TetR family  52.83 
 
 		 421 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.227831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 275 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6337  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2744  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46518  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1030  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2788  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3925  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.376299  normal  0.034998 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2595  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000390458  hitchhiker  0.00180541 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3160  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 414 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 275 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 403 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 423 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 283 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  30.56 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 278 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 277 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 278 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 278 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2774  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.783627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1382  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  32.83 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  27.63 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 280 aa  52  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4233  transcriptional regulator, TetR family  40.45 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0221768  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 205 aa  52  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  41.89 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 242 aa  51.2  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2572  regulatory protein TetR  43.08 
 
 		 238 aa  51.6  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  32.65 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  37.84 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1382  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 263 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  37.36 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>