222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3010 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3010  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2572  regulatory protein TetR  39.5 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3745  hypothetical protein  40.87 
 
 		 240 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239031  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  38.86 
 
 		 209 aa  121  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0691  TetR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.545949 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1382  transcriptional regulator, TetR family  40.95 
 
 		 241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9036  putative transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 214 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.505167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2689  putative transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 		 325 aa  108  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.559134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8662  transcriptional regulator, TetR family  38.62 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  35.08 
 
 		 210 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3693  regulatory protein TetR  35.05 
 
 		 216 aa  101  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000370458  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1030  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 220 aa  95.5  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 222 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1169  regulatory protein, TetR  34.98 
 
 		 225 aa  92.4  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1039  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3160  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5762  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182054  normal  0.0696367 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2744  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2788  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2774  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.783627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2595  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000390458  hitchhiker  0.00180541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4551  regulatory protein TetR  33.15 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1997  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0474929  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4042  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.229679  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4233  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0221768  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0872  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83423  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  51.47 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  60.47 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  45.59 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 214 aa  48.9  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1656  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 309 aa  48.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  44.83 
 
 		 194 aa  48.1  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 261 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3914  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.201642  normal  0.600336 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 248 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1288  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  47.37 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5224  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3383  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.606536  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3613  regulatory protein, TetR  35.79 
 
 		 243 aa  45.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 230 aa  45.8  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3925  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 213 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.376299  normal  0.034998 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 213 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  53.49 
 
 		 217 aa  45.8  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1788  regulatory protein TetR  39.71 
 
 		 219 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 192 aa  45.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2969  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 228 aa  45.1  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  29.31 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 191 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  30.29 
 
 		 182 aa  45.1  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 191 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 217 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  29.31 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3341  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 228 aa  45.1  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1572  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 228 aa  45.1  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  29.31 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  29.31 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3954  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 232 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  29.31 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4028  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 228 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  29.31 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3030  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 228 aa  45.1  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 200 aa  45.1  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0159  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 232 aa  45.1  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 224 aa  45.1  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6337  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  45.31 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6398  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237377  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0799  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126774  normal  0.374704 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>