More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1039 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1039  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1169  regulatory protein, TetR  86.55 
 
 		 225 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8662  transcriptional regulator, TetR family  45.03 
 
 		 207 aa  158  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 		 210 aa  141  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 212 aa  132  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9036  putative transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 214 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.505167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2689  putative transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 325 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.559134 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3010  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 218 aa  102  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0691  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.545949 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3160  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1997  TetR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0474929  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2774  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.783627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2744  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2788  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3745  hypothetical protein  35.24 
 
 		 240 aa  85.1  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239031  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2595  transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000390458  hitchhiker  0.00180541 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5762  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182054  normal  0.0696367 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3693  regulatory protein TetR  32.98 
 
 		 216 aa  78.2  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000370458  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2572  regulatory protein TetR  28.17 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1382  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4551  regulatory protein TetR  31.94 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  44.87 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6337  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  43.06 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  45.71 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  53.7 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  36.03 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 185 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  41 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6309  putative transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407991  normal  0.0813971 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  41.54 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  39.19 
 
 		 239 aa  52.8  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 291 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 209 aa  52.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 258 aa  52.8  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3134  hypothetical protein  29.95 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.744862  hitchhiker  0.000170906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 205 aa  52  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 213 aa  51.6  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 222 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 332 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 403 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1959  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0909176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  32.33 
 
 		 198 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 183 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  36.21 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  43.21 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>