More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5760 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 209 aa  418  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 220 aa  172  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 210 aa  147  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8662  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1169  regulatory protein, TetR  42.35 
 
 		 225 aa  138  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1039  TetR family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 223 aa  131  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  41.84 
 
 		 212 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3010  TetR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 218 aa  121  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2689  putative transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 325 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.559134 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2595  transcriptional regulator, TetR family  34.6 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000390458  hitchhiker  0.00180541 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0691  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.545949 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 222 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1382  transcriptional regulator, TetR family  38.97 
 
 		 241 aa  95.1  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9036  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 214 aa  93.2  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.505167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2572  regulatory protein TetR  31.03 
 
 		 238 aa  88.2  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2774  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.783627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5762  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182054  normal  0.0696367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3745  hypothetical protein  37.25 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239031  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2744  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 214 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2788  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 214 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1997  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0474929  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3693  regulatory protein TetR  32.35 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000370458  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1030  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 199 aa  62  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  52.73 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3160  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  34.96 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  21 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  21 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  37.76 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 268 aa  54.7  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1614  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0287431  hitchhiker  0.0000000422838 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3703  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4551  regulatory protein TetR  31.76 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1423  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.6699 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3280  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3612  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000248131  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3389  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3352  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000543998  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3621  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3654  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.786622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3605  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.02462e-25 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 266 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 228 aa  52.8  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  43.86 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  30.56 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  42.62 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 255 aa  52.4  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>