More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5637 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 220 aa  431  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  47.47 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  45.37 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1169  regulatory protein, TetR  43.33 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  42.71 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8662  transcriptional regulator, TetR family  43.32 
 
 		 207 aa  144  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1039  TetR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 223 aa  141  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3010  TetR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2689  putative transcriptional regulator, TetR family  36.74 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.559134 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2595  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000390458  hitchhiker  0.00180541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9036  putative transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.505167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3693  regulatory protein TetR  33.18 
 
 		 216 aa  96.7  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000370458  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0691  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 218 aa  95.5  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.545949 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3160  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 212 aa  88.2  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3745  hypothetical protein  37.32 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239031  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5762  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 204 aa  85.5  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182054  normal  0.0696367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1997  TetR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 209 aa  85.1  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0474929  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2744  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46518  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1382  transcriptional regulator, TetR family  34.3 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2788  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2774  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.783627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1030  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2572  regulatory protein TetR  30.14 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 263 aa  62  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4417  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  46.48 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4042  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.229679  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  41.33 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  45.07 
 
 		 255 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  36.67 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4551  regulatory protein TetR  32.68 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5045  transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.301448 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  42.11 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  30.37 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  41.54 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  48.28 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18080  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  50.85 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  33.55 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  55.77 
 
 		 190 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 256 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3134  hypothetical protein  28.96 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.744862  hitchhiker  0.000170906 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5412  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00435132  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  49.28 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  53.06 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 257 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01975  hypothetical protein  39.62 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.10817  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  35.78 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3394  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222962 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  40.79 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0374  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.120665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>