More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0265 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  394  1e-109  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 200 aa  136  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0008  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.643837 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  25.63 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 197 aa  62  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  38.57 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 221 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  28.84 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  22.63 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  41.82 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  28.69 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  33.64 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  30.47 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  52.83 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 414 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 388 aa  58.2  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 200 aa  57.8  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  28.72 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0970  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1668  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3674  nucleoid occlusion protein  28.38 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00408157  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 257 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1103  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.523139 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  23.31 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>