More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0340 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 388 aa  750    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  44.7 
 
 		 390 aa  279  7e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  40.55 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  40.93 
 
 		 470 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 385 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 391 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 412 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 412 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 412 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 406 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 425 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  26.65 
 
 		 408 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  30.68 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 424 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 451 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 193 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 451 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 193 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 215 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 194 aa  71.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  45.12 
 
 		 197 aa  71.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 197 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 197 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 197 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  32.22 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  45.56 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 207 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 207 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 204 aa  67  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 195 aa  65.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  41.24 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 193 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  41.43 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  35.05 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  37.33 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 206 aa  59.3  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 225 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 197 aa  59.3  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 236 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 201 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 215 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1551  transcription regulator protein  25.47 
 
 		 205 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000200418  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3711  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336995  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 203 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  17.22 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  33.6 
 
 		 220 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 202 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 203 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01975  hypothetical protein  31.43 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.10817  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  54 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 213 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 231 aa  57  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  28.19 
 
 		 236 aa  57  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 206 aa  57  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>