More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1507 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  98.3 
 
 		 412 aa  816    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 412 aa  829    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 412 aa  829    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 394 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 394 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 394 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 393 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  31.98 
 
 		 400 aa  189  8e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 424 aa  156  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  32.48 
 
 		 403 aa  153  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 425 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 408 aa  133  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 410 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 385 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 470 aa  126  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  27.58 
 
 		 391 aa  110  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 451 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 428 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  26.32 
 
 		 390 aa  95.9  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 204 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 195 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 196 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 193 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 193 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 197 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 194 aa  67  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 190 aa  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 309 aa  66.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 192 aa  65.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 770 aa  64.7  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  52.83 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  31.39 
 
 		 213 aa  59.3  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 211 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 227 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 240 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 497 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  30.66 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 424 aa  57  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 209 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 206 aa  55.8  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  26.29 
 
 		 210 aa  55.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 210 aa  56.2  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1167  regulatory protein TetR  43.33 
 
 		 220 aa  55.1  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000201787  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 211 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 225 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 201 aa  55.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 223 aa  55.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 222 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 223 aa  54.7  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 216 aa  54.3  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 		 230 aa  54.3  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6448  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 222 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264064  hitchhiker  1.59583e-16 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 197 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 211 aa  54.3  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 212 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 244 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 232 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 239 aa  53.9  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 256 aa  53.5  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  28.15 
 
 		 207 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4052  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 160 aa  53.5  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587614  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 201 aa  53.5  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 210 aa  53.1  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 200 aa  53.1  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1096  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 192 aa  53.1  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 228 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 210 aa  53.1  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  36.47 
 
 		 237 aa  53.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  26.83 
 
 		 220 aa  53.1  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>