More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1731 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 196 aa  388  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  59.56 
 
 		 195 aa  204  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  58.47 
 
 		 197 aa  204  9e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  56.32 
 
 		 222 aa  182  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  54.01 
 
 		 195 aa  180  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  60.99 
 
 		 182 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 207 aa  160  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  50.27 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  53.29 
 
 		 197 aa  159  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  52.02 
 
 		 190 aa  151  7e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  54.71 
 
 		 195 aa  145  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 206 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 206 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  53.04 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  49.73 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  46.35 
 
 		 204 aa  140  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  48.5 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 193 aa  137  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  43.01 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  45.68 
 
 		 206 aa  128  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  48.92 
 
 		 194 aa  127  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4052  TetR family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 160 aa  125  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587614  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 193 aa  91.3  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 220 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06840  transcriptional regulator, tetR family  39.86 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  30.05 
 
 		 400 aa  82.8  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 425 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 363 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  34.07 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 408 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 412 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 412 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 410 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 412 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  32.84 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  29.14 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 385 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 238 aa  64.7  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 220 aa  62  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 391 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  38.3 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 394 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 394 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  28.93 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 394 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  33.79 
 
 		 260 aa  58.5  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  34.35 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 291 aa  57.8  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 307 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2782  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0324  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0304  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.826155  hitchhiker  0.000375508 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2863  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603343 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  32.82 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 470 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6699  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.678516  normal  0.427356 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3668  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0040426  hitchhiker  0.0000000599644 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0243  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0252  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>